Η Ειρήνη Σπανάκη διδάσκει στο Πανεπιστήμιο Κρήτης και στη Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών με γνωστικό αντικείμενο «Ειδική Αγωγή και Διδακτική των Θετικών Επιστημών». Τα αντικείμενα που πραγματεύεται σχετίζονται με τη συμπερίληψη, την ειδική αγωγή, τη διαπολιτισμικότητα και τη συμβουλευτική, καθώς και με το πιστοποιητικό παιδαγωγικής και διδακτικής επάρκειας. Πρόσφατα ανέλαβε στο τμήμα Μαθηματικών και Εφαρμοσμένων Μαθηματικών του Πανεπιστημίου Κρήτης το μάθημα «Θέματα Διδακτικής Μαθηματικών: Διδασκαλία μαθητών με μαθησιακές δυσκολίες στα μαθηματικά και στον γραπτό λόγο». Επί σειρά ετών διδάσκει αναπτυξιακή ψυχολογία, εκπαιδευτική ψυχολογία και συμβουλευτική ψυχολογία και προσανατολισμό στην ΑΣΠΑΙΤΕ, ενώ έχει συνεργαστεί με το Πανεπιστήμιο Λευκωσίας στο μεταπτυχιακό πρόγραμμα ειδικής αγωγής κι εκπαίδευσης και με το ΕΑΠ στο μεταπτυχιακό πρόγραμμα για τις επιστήμες αγωγής. Έχει συμμετάσχει σε πολλά επιμορφωτικά προγράμματα στη σχολική ψυχολογία, στη διαφοροποίηση της διδασκαλίας και στα αναλυτικά προγράμματα (ΙΕΠ) ενώ είναι πιστοποιημένη εκπαιδεύτρια ενηλίκων.
Παράλληλα, έχει πλούσια εμπειρία στη διάγνωση και αξιολόγηση μαθητών/τριών και στη σύσταση συμπεριληπτικών εκπαιδευτικών προγραμμάτων εστιασμένων στις ανάγκες των μαθητών /τριών μέσα από την πολυετή υπηρέτησή της ως ειδική παιδαγωγός σε διεπιστημονικές ομάδες στα ΚΕΔΔΥ–ΚΕΣΥ Ηρακλείου. Επιπρόσθετα, έχει συμμετάσχει σε πληθώρα επιμορφωτικών ενδοσχολικών δράσεων ως επιμορφώτρια στην πρωτοβάθμια και δευτεροβάθμια εκπαίδευση με κύρια θέματα τις συμπεριληπτικές στρατηγικές και παρεμβάσεις, αλλά και τη διαχείριση των συγκρούσεων. Τα βασικά ενδιαφέροντά της σχετίζονται με τη συμπερίληψη για όλους/ες τους/τις μαθητές/τριες, με τη διαφοροποίηση της διδασκαλίας και με την προσαρμογή των μαθητών/ τριών στο σχολικό–ακαδημαϊκό πλαίσιο γνωστικά, συμπεριφορικά σωματο-κινητικά και κοινωνικο-συναισθηματικά. Έμπρακτα αποδεικνύεται η μεγάλη αγάπη για το αντικείμενο της ειδικής αγωγής και για την συνεκπαίδευση όλων των μαθητών/τριών μέσα από το ερευνητικό και συγγραφικό της έργο. Οι ερευνητικές μελέτες και δημοσιεύσεις της εστιάζουν κυρίως στον σχεδιασμό και την υλοποίηση εκπαιδευτικών παρεμβατικών προγραμμάτων για μαθητές/τριες με ή χωρίς δυσκολίες, με απώτερο σκοπό τη συμπερίληψη όλων των μαθητών/τριών στο ανοικτό ελληνικό σχολείο αλλά και την τριτοβάθμια Εκπαίδευση.
